在1861年至1865年期间，连续三个图案作为美利坚邦联（“邦联”或“邦联”）的官方国旗。
自美国内战结束以来，在美国哲学、政治、文化和种族争议下，私人和官方使用邦联旗帜以及带有衍生图案的旗帜一直在继续。这些包括在各州展示的旗帜；城市、城镇和县；学校、学院和大学；私人组织和协会；和个人。
密西西比州的州旗以南部邦联军队的战旗为特色，或左上角，这是目前唯一这样做的美国州旗。佐治亚州的州旗非常类似于邦联的第一面国旗“星条”；包含邦联战旗的先前设计从1956年一直使用到2001年。
1861年3月4日至1863年5月1日，邦联的第一面官方国旗飘扬，通常被称为星条旗。它是由阿拉巴马州马里恩的德国/普鲁士艺术家尼古拉·马沙尔设计的，类似于马沙尔熟悉的奥地利国旗。“星条旗”于1861年3月4日在阿拉巴马州蒙哥马利的第一个临时国家首都被采用，并在第一个邦联国会大厦的圆顶上升起。Marschall还设计了邦联军服。
北卡罗莱纳州路易斯堡的一座纪念碑声称，“星星和酒吧”“由北卡罗莱纳州的一个儿子/奥伦·伦道夫·史密斯设计/由凯瑟琳·丽贝卡（墨菲）温伯恩在他的指导下制作。/转交阿拉巴马州蒙哥马利。1861年2月12日，/1861年3月4日临时国会通过”。
临时邦联国会的第一批行动之一是成立国旗和印章委员会，由来自南卡罗来纳州的国会议员兼吞火人威廉·波彻·迈尔斯担任主席。该委员会要求公众就这一主题提交想法和观点，正如历史学家约翰·M·科斯基（John M.Coski）所说，“被不要放弃美国‘旧国旗’的要求淹没了”。迈尔斯已经设计了一面后来被称为邦联战旗的旗帜，他更喜欢他的旗帜而不是“星星和条纹”的提议。但考虑到类似美国国旗（“星条旗”——最初于1777年6月独立战争期间建立和设计）的广泛支持，“星条旗”设计获得了委员会的批准。
当美国内战爆发时，“星条”在布尔朗的第一场战役中引起了战场上的混乱，因为它与美国国旗相似，尤其是当它软绵绵地悬挂在旗杆上时。“星星和酒吧”也因其与美国国旗相似而受到意识形态的批评。许多邦联不喜欢星星和栅栏，认为它象征着邦联为了维护奴隶制而脱离的中央集权联邦政权。早在1861年4月，即国旗采用一个月后，一些人就已经在批评国旗，称其为对美国国旗的“奴性模仿”和“令人厌恶的模仿”。1862年1月，乔治·威廉·巴格比（George William Bagby）为《南方文学信使》（Southern Literary Messenger）撰稿，写道许多邦联成员不喜欢这面旗帜。“每个人都想要一面新的邦联旗帜，”巴格比写道。“现在的一面被普遍憎恨。它很像北方佬的旗帜，这足以让它变得难以言喻地令人厌恶。”《查尔斯顿水星报》的编辑也表达了类似的观点：“人们似乎普遍认为‘星星和酒吧’永远不会适合我们。它们太像不光彩的‘扬基嘟嘟旗’了……我们想象‘战旗’将会成为广受好评的南方旗。”总部位于萨凡纳的《每日晨报》编辑威廉·汤普森（William T.Thompson）也反对国旗，因为它在美学上与美国国旗相似，对一些邦联来说，美国国旗与解放和废奴主义有负面联系。汤普森在1863年4月表示，他不喜欢采用的国旗，“因为它与我们正在与之斗争的废除专制的国旗相似。”
在邦联使用国旗的过程中，更多的星星被添加到国旗的广州，最终使国旗上的星星总数达到13颗。这反映了邦联宣称已经接纳肯塔基州和密苏里州加入邦联。尽管他们在邦联国会会议期间都有代表，并且有由被废黜的前州政治家组成的影子政府，但这两个州都没有完全由邦联控制或管理。13星旗的首次展示是在肯塔基州巴兹敦的本·约翰逊大厦外；13星设计也被用作邦联海军的战斗旗。
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